Cambio di cognome minorenne: come si fa?

Io sono Italiana e' il mio marito e' Ucraino. Il nostro figlio ha entrambi la cittadinanza Italiana e Ucraino. Mio figlio e' nato in Olanda e a quell'epoca non ero sposata con mio marito e lui lavorava all'estero. La legge Olandese stipula che se non siete sposati e il padre non e' fisicamente presente tre giorni dopo la nascita non si puo' dare il suo cognome. Allora io ho fatto tutti i documenti italiani per mio figlio (tramite il Consolato Italiano in Olanda) con il mio cognome. Dopo, quando mio marito ci ha raggiunti in Olanda siamo andati al commune in Olanda e lui ha riconosciuto il nostro figlio e abbiamo cambiato il suo cognome a quello di mio marito. Adesso siamo tornati in Italia (siamo fuggiti dall'Ucraina ma mio marito non ci puo' raggiungere per adesso) e mio figlio ha quasi tutti i suoi documenti con il cognome del padre ma nel sistema Italiano e registrato con il mio cognome. Sono stata al commune e non accettano i documenti di cambio di cognome che ho fatto in Olanda. Adesso non so se questo e una questiona di tribunale o se posso semplicemente andare in prefettura.