Penale e saldo lavori di ristrutturazione casa

Buongiorno,ho stipulato contratto di appalto per ristrutturazione del mio immobile, nel contratto il termine di fine lavori era previsto per il 15/05/2022 ed è prevista una penale pari a 100 euro per ogni giorno di ritardo. I ritardi sono scaturiti da problemi di liquidità della ditta a seguito dei blocchi di cessione del credito per sconto in fattura sui diversi cantieri gestiti da loro in precedenza. I lavori sono praticamente terminati ad inizio agosto, il saldo finale che dovrei corrispondere alla ditta è nettamente inferiore alla penale che dovrebbero corrispondermi. Vorrei tutelarmi prima dell'invio della fattura finale, mi potreste indicare la modalità corretta? Dal mio punto di vista vorrei chiudere la pratica senza pagar più nulla . Ringraziando in anticipo per la cortese attenzione, cordialmente